養殖污水具有典型的“三高”特征即有機物濃度高COD高達3000-12000mg/L，氨氮高達800-2200mg/L，懸浮物SS超標數十倍；含磷量較高，可生化性一般；臭味大；沖洗排放時間集中，沖擊負荷大。

來自養殖場的廢水首先進入集水井蓄積水量，然后用泵提升至固液分離機進行分離。設置固液分離機的目的是去除廢水中的糞類物料，避免進入后續沼氣池，造成沼氣池的堵塞，從而導致清理困難和無法使用的后果。在糞便進入沼氣池前進行固液分離措施，既可解決牛糞在沼氣池的沉淀問題，極大增強沼氣池的處理能力，又可大大減小沼氣池、生化池的建設面積。節省環保處理的建設投資和土地使用面積，分離出的牛糞還可直接作為果樹、林木施肥和作為有機肥的原料。

固液分離機分離出的廢水進入沉淀池，沉淀分離廢水中的細小的懸浮顆粒，分離出的沉淀物定期排入集泥池，污水則進入調節酸化池。

系統配置調節酸化池的目一是調節水量，二是廢水預酸化，提高厭氧單元的效率。

廢水進入UASB反應器進行厭氧反應，大量去除廢水中的COD、BOD，將其轉化為沼氣。UASB反應器的出水進入絮凝反應罐，產生的沼氣則經過封罐，再經過脫硫罐和水封罐進入氣柜貯存。沼氣通過沼氣發電機進行發電，供給廢水處理系統用電。

廢水在PH調節罐中投加石灰水，調整PH值進行調理后，自流進入沉淀池II進行沉淀分離，污泥則排入集泥池。

污水經過厭氧處理后，通過硝化及反硝化作用，配水池的廢水蓄積水量后，用泵提升分配給好氧池。

   廢水在好氧進行好氧反應，利用池中好氧微生物的代謝作用將大量的有機污染物和氨氮去除，從而使廢水得到了凈化。污泥則排入集泥池。