1.預防消毒。即為預防傳染病的發生而進行的消毒。就是平時未發生傳染病時，結合飼養管理，對畜（禽）舍、場地、用具和飲水等定期進行清掃（洗）消毒。要求：對養殖場周圍環境至少每月進行2次大清掃、大消毒；對欄舍、通道每天清掃，每周消毒2次；對畜（禽）體表每周噴霧消毒一次；用具，為預防感染，都應事前徹底消毒；外來車輛和人員入場和飼養員進入欄舍，都要進行消毒。其目的就是預防傳染病的發生和傳播。

2.臨時消毒。發生傳染病時，為了及時消滅剛從傳染源排出的病原微生物而采取的消毒叫臨時消毒。消毒的對象是畜舍、隔離場地、病畜（禽）的分泌物和排泄物，以及可能被污染的一切場所、用具和物品。此類消毒要求多次重復、徹底，尤其是病畜（禽）舍必須每天消毒2次以上。

3.終末消毒。在病畜（禽）轉移、痊癒、死亡而解除封鎖（隔離）后，或在疫區解除封鎖前，為徹底消滅疫區內可能殘留的病原微生物而進行的全面大消毒叫終末消毒。此種消毒則要求全面而徹底，以防傳染病復發。

二、消毒方法

1.機械消除法。在無傳染病的情況下，可采用機械或人工方法清掃、洗刷、通風等方法消除病原微生物。如清除對畜（禽）體表污物、對畜（禽）舍地面清除糞便、墊草、飼料殘渣。對車輛、工具上的污物用高壓水沖洗、對工作服和鞋帽進行洗滌等，都屬于機械清除法。目的是將病原體污染物集中，進行堆積發酵、掩埋、焚燒，最終殺滅病原微生物。