1 、用惠民EM菌處理雞糞。
將惠民EM菌液（原液）兌水稀釋后，按一噸雞糞2千克惠民EM菌的比例混合，用塑料布密封堆積發酵。這樣能有效的殺滅病原微生物，并扶持有益菌的增殖，使雞糞的臭味變香味，且大幅度的提高了雞糞的營養成分。經過惠民EM菌處理的雞糞，蒼蠅，蚊子也很少在雞糞上滋生繁殖，可以作為優質的微生物有機肥施用到農田，蔬菜棚內、果園林地等。
2、用惠民EM菌液（原液）發酵雞日糧或飲水。
將惠民EM菌液按200倍稀釋，按一噸飼料5千克惠民EM菌液的比例拌和在雞日糧中（精飼料）混勻，2小時后飼喂。或用惠民EM菌液200-500倍稀釋后作為飲水用。這樣雞排出的糞便大大的降低了臭味，且使雞的抗病力增強，生產性能得到了提高，大大降低了舍內的有害氣體的含量。
3、用惠民EM菌液清除雞舍的有害氣體。
惠民EM菌能把促成惡臭物質的氨、硫化氫、甲基硫醇、三甲胺等當做食餌（基質）來分解掉。因此用惠民EM菌液50—80倍的稀釋量噴灑雞舍地面，通道，墻壁等，臭味可明顯的消失。
4、用惠民EM菌制作發酵床。
多年來用惠民EM菌制作發酵床已廣為人知，這里就簡單的介紹下。就是把農村的廢棄物料，只要是疏松透氣的材料都可以合理的安排選用，比如，鋸末、稻殼、秸稈等，這些材料和惠民EM菌或惠民EM菌系列的發酵床專用菌粉混合下，調節水分， 堆積在圈舍里三天左右，然后鋪開養雞。發酵床的目的就是發酵、分解、轉化動物的糞尿，使其轉化為一種高蛋白的營養食料，供給動物食用。做了發酵床，徹底沒有了糞便的污染，解決了糞便問題，動物生活在一個干凈的微生態環境下，大大的降低了發病率，減少了醫藥費的投入，降低了死亡率，同時促進了動物的生長，節省了部分飼料。